Один з найдосвідченіших гравців серед новоградських профі-футболістів розпочав свою кар’єру виступаючи у ДЮФЛ за "Динамо", "Динамо-2", "Волинь" Луцьк та "УФК Харків".
З 2004 по 2009 роки грав за "Рось" Біла Церква, "Коростень", "Житомир".
У 2010-му Юрій у складі "Звягеля-750" виграє чемпіонат Житомирської області і "срібло" аматорського чемпіонату України. Після вдалого сезону, Періна запрошують до свердловського "Шахтаря" з яким Юрій завойовує бронзу у Другій лізі.
Провівши 2 сезони за свердловський клуб Юрій вирушає до "Карлівки". Потім були "Гірник" Кривий ріг (2014-2015), "Інгулець" Петрове (2015). Узимку 2016 року футболіст перебрався до чернівецької "Буковини". На початку грудня 2016 року Юрій Перін припинив співпрацю з чернівецькою командою.
